Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt25Q8VCW2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt25Q8VCW2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt25Q8VCW2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt25Q8VCW2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt25Q8VCW2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt25Q8VCW2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt25Q8VCW2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt25Q8VCW2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt25Q8VCW2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms