Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc9Q8VC31 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc9Q8VC31 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc9Q8VC31 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc9Q8VC31 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms