Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610009B22RikQ8R3W2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
0610009B22RikQ8R3W2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms