Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Vmn1r200Q8R281 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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Vmn1r200Q8R281 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Vmn1r200Q8R281 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Vmn1r200Q8R281 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Vmn1r200Q8R281 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Vmn1r200Q8R281 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vmn1r200Q8R281 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Vmn1r200Q8R281 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r200Q8R281 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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