Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitrm1Q8K411 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pitrm1Q8K411 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitrm1Q8K411 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitrm1Q8K411 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms