Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin28aQ8K3Y3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lin28aQ8K3Y3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin28aQ8K3Y3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms