Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nsl1Q8K305 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nsl1Q8K305 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms