Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2h5Q8K2X8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2h5Q8K2X8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms