Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stn1Q8K2X3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Stn1Q8K2X3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stn1Q8K2X3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms