Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c1Q8K284 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c1Q8K284 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf3c1Q8K284 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c1Q8K284 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms