Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek9Q8K1R7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek9Q8K1R7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek9Q8K1R7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
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