Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc45a3Q8K0H7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc45a3Q8K0H7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc45a3Q8K0H7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms