Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmbrd1Q8K0B2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd1Q8K0B2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms