Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LgsnQ8CIX8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
LgsnQ8CIX8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms