Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc45Q8CIM1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lrrc45Q8CIM1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc45Q8CIM1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms