Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rab11fip3Q8CHD8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab11fip3Q8CHD8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms