Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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