Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atad2Q8CDM1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atad2Q8CDM1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atad2Q8CDM1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms