Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc87Q8CDL9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc87Q8CDL9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc87Q8CDL9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc87Q8CDL9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms