Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas3Q8CCN5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bcas3Q8CCN5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcas3Q8CCN5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcas3Q8CCN5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms