Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E4f1Q8CCE9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
E4f1Q8CCE9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1556 ms