Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps53Q8CCB4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps53Q8CCB4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps53Q8CCB4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms