Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrip1Q8CBD1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrip1Q8CBD1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms