Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo48Q8CAT8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo48Q8CAT8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms