Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A430089I19RikQ8C9W1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A430089I19RikQ8C9W1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms