Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin9Q8C735 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lin9Q8C735 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lin9Q8C735 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms