Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdac7Q8C2B3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac7Q8C2B3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153 ms