Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Camsap2Q8C1B1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Camsap2Q8C1B1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Camsap2Q8C1B1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Camsap2Q8C1B1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Camsap2Q8C1B1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms