Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg16l1Q8C0J2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms