Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccser1Q8C0C4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccser1Q8C0C4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccser1Q8C0C4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms