Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rbbp5Q8BX09 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms