Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pggt1bQ8BUY9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pggt1bQ8BUY9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pggt1bQ8BUY9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms