Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smad3Q8BUN5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad3Q8BUN5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms