Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubr7Q8BU04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubr7Q8BU04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubr7Q8BU04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubr7Q8BU04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms