Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scfd2Q8BTY8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Scfd2Q8BTY8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scfd2Q8BTY8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scfd2Q8BTY8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scfd2Q8BTY8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scfd2Q8BTY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms