Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Suds3Q8BR65 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Suds3Q8BR65 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Suds3Q8BR65 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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