Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga3Q8BMI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga3Q8BMI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga3Q8BMI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga3Q8BMI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms