Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Me3Q8BMF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Me3Q8BMF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me3Q8BMF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Me3Q8BMF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms