Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem260Q8BMD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem260Q8BMD6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms