Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D130040H23RikQ8BII3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D130040H23RikQ8BII3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D130040H23RikQ8BII3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms