Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Best2Q8BGM5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best2Q8BGM5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms