Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1l4Q8BGJ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1l4Q8BGJ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1l4Q8BGJ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms