Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jmjd4Q8BFT6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Jmjd4Q8BFT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Jmjd4Q8BFT6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Jmjd4Q8BFT6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms