Protein–RNA interactions for Protein: Q810Y9

Pramel6, PRAMEl6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel6Q810Y9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel6Q810Y9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramel6Q810Y9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramel6Q810Y9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms