Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ChfrQ810L3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChfrQ810L3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChfrQ810L3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms