Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms