Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc181Q80ZU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc181Q80ZU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc181Q80ZU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms