Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cct8l1Q80YT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cct8l1Q80YT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct8l1Q80YT3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms