Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed4Q80WQ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zbed4Q80WQ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed4Q80WQ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed4Q80WQ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed4Q80WQ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed4Q80WQ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed4Q80WQ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed4Q80WQ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed4Q80WQ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms