Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClmQ7TSN2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms