Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IfnkQ7TSL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IfnkQ7TSL0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IfnkQ7TSL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IfnkQ7TSL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IfnkQ7TSL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IfnkQ7TSL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IfnkQ7TSL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms